Navegando pela internet, encontrei uma UI (User Inteface) para o utilitário "aspnet_compiler.exe". Ela pode ser adquirida gratuitamente neste endereço: http://www.west-wind.com/tools/aspnetcompiler.asp
Outro post que me chamou a atenção foi o que Scott Allen fez aqui. Ele fala dos diversos arquivos *.dll que são criados na pré-compilação do ASP.NET 2.0. Vejam o tópico "What’s In Your Bin Directory?" deste post.