Um dos grandes problemas (bug?) que temos nas versões 1.x do ASP.NET é que os atributos do objeto ListItem (usado para preencher controles como DropDownLists, ListBoxes, etc.) não são renderizados, logo, se quisésemos definir uma cor de background em um item do DropDownList, não era possível, a menos que fizessemos algo como o Scott Mitchell mostra neste artigo.
A boa notícia é que isso foi resolvido na versão 2.0 do ASP.NET e agora podemos fazer o que já cansamos de tentar nas versões anteriores:
foreach (ListItem item in this.DropDownList1.Items)
{
item.Attributes.Add("style", "background-color: Red");
}